Уфа - это столица республики Башкортостан, важный железнодорожный узел. Ж/д линии, проходящие через город, обеспечивают стыковку западных и центральных районов с Уралом, Сибирью.
Город обслуживает станция Уфа, которая является центром Башкирского отделения Куйбышевской ЖД. В городе, кроме пассажирской находится еще 9 ж/д станций. Станция Уфа в день обслуживает больше шестидесяти составов дальнего следования. На станции шесть пассажирских платформ, которые соединены подземным переходом и надземным пешеходным мостом. Выход на перрон осуществляется через турникеты. Вокзал недавно реконструировался - в 2011 г., оборудован эскалаторами, комфортными залами ожидания.
Между Уфой и столицей (1620 км расстояние) курсирует фирменный поезд «Башкортостан», который прибывает на Казанский вокзал столицы. Через Уфу проезжает фирменный Челябинск—Москва «Южный Урал». До северной столицы из столицы Башкортостана можно доехать на скором поезде всего за сорок с небольшим часов.
Через Уфу следуют международные маршруты в города Казахстана - Астану, Караганды, на Украину в Симферополь и Одессу, в столицу Азербайджана - Баку, в столицу Узбекистана - Ташкент. Через станцию проходит поезд дальнего следования, соединяющий Белоруссию и Казахстан - рейс Караганды-Брест. Со станции можно попасть без пересадок в Белгород, Новосибирск, Астрахань, Нижневартовск, Пензу, Сибай, Челябинск, Екатеринбург, Самару, Красноярск, Северобайкальск, Иркутск, Кисловодск, Тынду, Владивосток, Тюмень, Ульяновск, Новокузнецк, Новый Уренгой. Летом назначаются дополнительные составы в южном направлении на Анапу и Адлер.
В городе находится вторая крупная узловая станция Чишминского направления - Дёма. Отсюда идут линии на Чишмы, Кропачёво, Оренбург, Инзер. Башкирское отделение Куйбышевской ЖД расположено в Респ. Башкортостан, захватывает Татарстан, часть Оренбургской, Челябинской областей. Общая протяженность дороги - 1325 км. На отделении функционируют 45 станций.
Ж/д сеть Куйбышевской ЖД представляет 2 параллельные линии с запада на восток: Кустарёвка — Инза — Ульяновск, Ряжск — Самара. Линии соединяются на ст. Чишмы. От ст. Уфа идёт ветка до ст. Карламан, где расходятся на направление до Белорецка и Магнитогорска и на линию до Стерлитамака, Салавата, Мелеуза, Кумертау. Еще 2 ветки Рузаевка — Пенза — Ртищево, Ульяновск — Сызрань — Саратов идут с севера на юг.